A. 疾病負擔研究(GBD)-如何讓風險因素數據更好看
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本文是系列推文的第七篇,在前幾篇介紹了高分示例文章中的圖形後,我們已能呈現簡單的發病率及死亡率數據。接下來,常規分析將增加關於風險因素的結果展示。以發表在《Lancet》子刊上的文章《The global, regional, and national burden of oesophageal cancer and its attributable risk factors in 195 countries and territories, 1990–2017: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2017》為例,圖5展示了影響食管癌DALY的影響佔比。
為分析這一部分數據,我們需要下載相應數據,設置Context、時間和地區選項,選擇Measure為Deaths以及DALY,Risk選擇與文字一致的變數。
下載數據後,分析圖的構成,根據5個變數有5張圖,需得到每個地區每個風險因素對DALY的影響佔比。同時,可合並Deaths以及DALY在一幅圖中,先從風險因素入手。
設置路徑讀取數據後,獲取BMI對Deaths及DALY的影響佔比,使用ggplot2包做柱狀圖。
最終得到的圖形如下,可在AI中調整圖例完成。
按照同樣的方法繪制其他四個風險變數的圖形,然後在AI中合並成一幅圖形。
此外,可利用ggplot2的圖像分光鏡功能,將risk factor分成5張子圖顯示。
讀取2019年的所有risk factor,加上facet_grid即可作圖。
得到的圖形如下,在AI中調整圖形,將每個柱形圖上的數字左右上下調整即可。
根據上述代碼進行實操,如需代碼,請關注公眾號——小明學習室,回復關鍵詞「GBD」獲取。