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常用医学数据挖掘方法

发布时间:2025-08-13 05:25:43

① 医学数据挖掘:同源重组修复缺陷(HRD)分析

揭示癌症密码:HRD深度解析与医学新策略


在2022年的癌症研究领域,《NPJ Precis Oncol》杂志聚焦于同源重组修复缺陷(HRD)这一关键概念,特别是在基因组疤痕的揭示中。HRD,包括HR(homologous recombination)、HRR(heteroplex repair)和HRDsum评分,构成了癌症基因组研究的核心组成部分。文章引用了TCGA、Huang et al.、PanCanAtlas和GDC等多个重要数据源,涵盖了众多肿瘤类型的深入分析。


一项引人注目的发现是,BRCA1/2突变与HRD之间的紧密关联,不同HRR基因突变亚型呈现出显着的HRD差异。HRD与肿瘤的TMB(tumor mutational burden)、突变特征以及dMMR(plicated mismatch repair)的关联性尤为显着,并在BRCA1/2状态中与基因组疤痕形成鲜明对比。图1和补充图2生动展示了这些复杂关系的直观证据。


文章进一步探讨了TAI(telomeric allelic imbalance)和LST(large-scale state transition)等方法在区分H1a和H3类肿瘤方面的精准性,HRDsum在11种癌症类型中表现出卓越的区分能力,特别是在BRCA等特定癌症中的SBS3分析。双等位基因(BA)和单等位基因(MA)HRR突变的研究揭示了功能丧失与BA突变相关,而MA则维持功能。尤其引人关注的是,BRCA1启动子的高甲基化与HRDsum评分存在显着关联,这为新的分子分类提供了依据——"H1a,BA/HM"类别。


以单肿瘤HRD研究为例,胰腺癌的研究发展了24-GPS特征,有望在个体化HRD检测中发挥重要作用,影响预后和治疗选择。乳腺癌脑转移的分析揭示了原发灶和转移灶的分子差异,为临床治疗策略提供了新见解。通过转录组特征的深入挖掘,发现了基因组和转录组水平的功能相关HRD,这为分子分型和突变分析提供了新视角。


前列腺癌研究发现,HRD在BRCA1/2突变样本中与治疗响应相关,提示部分患者可能从PARP抑制剂中受益。而卵巢癌的研究则通过HRD评分划分预后亚型,推动了个性化治疗的进展。更多医学数据挖掘的杰作,揭示了HRD在癌症类型研究中的关键作用,为未来的治疗策略提供了强有力的支持。深入探索癌症的基因组奥秘,我们正逐步揭开新的治疗可能。【详情请参阅相关链接】

② 真实世界研究(RWS)概述

医学领域的真实世界研究-RWS,是指基于现实生活中的数据和情境,探索和评估医疗健康服务、药物和治疗方案等在实际使用中的效果和安全性的一种研究方法。与传统临床试验不同,RWS更加注重真实世界中各种因素对研究结果的影响,具有更广泛的适用性和代表性。利用电子病历数据、健康保险记录、家庭医生数据库等多源数据,可以对疾病诊断、治疗效果、药品使用和不良事件等进行观察和分析,帮助医学专业人员和政策制定者了解医疗系统实际情况,改善临床实践,推进新型药物开发和市场准入。



真实世界研究与随机对照试验(RCT)存在以下区别:真实世界研究通常通过分析来自现实生活中不同来源、类型、格式的大量数据来获取结论,适用于探索和研究各种问题,而RCT则在受试者之间随机分配不同的干预措施,以比较效果,能够较好地排除其他因素影响,评估干预措施的疗效和安全性。RWS更加注重现实生活中的情境和数据,研究者需考虑数据来源、质量、可靠性以及患者个体差异和治疗方案多样性。



真实世界研究常用方法包括基于数据挖掘和分析、队列研究、病例对照研究、跨领域协作研究等。数据来源广泛,包括电子媒体、电子健康记录、社会保障信息、私人征信机构数据、传感器和生物监测仪器等。在进行研究时,必须遵守法律和伦理标准,确保数据合规和隐私安全。



真实世界研究合规性问题涉及知情同意、数据安全管理以及伦理合规。研究者需获得被研究者同意,明确告知研究目的、风险和利益,加强数据安全,并尊重个人隐私和机构利益,避免负面影响和不当干扰。



真实世界研究存在数据收集、处理和分析的挑战,以及遵循伦理规范和法律法规的限制。然而,随着物联网、大数据等技术的快速发展,真实世界研究在学术研究、商业决策等领域具有广阔的应用前景。未来,我们可以期待真实世界研究在多个领域得到更广泛的应用,同时探索有效方法和技术克服挑战。



在处理非结构化数据时,真实世界研究面临难点。大体量数据的处理需要专业NLP工程师或众包方式,成本和周期较长。AI助手如“知否AI”可以对非结构化数据进行完美抽取和结构化,提供高效的数据处理方案。



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③ 统计学检验方法有哪些

统计学的检验方法主要包括以下几种:

一、假设检验法

假设检验法是一种基于假设的统计推断方法。这种方法通过提出假设,然后收集数据来验证假设是否成立。常用的假设检验法包括t检验、卡方检验等。这些检验方法都有其特定的应用条件和适用范围,需要根据实际情况选择适当的检验方法。

二、方差分析法

方差分析法主要用于分析多个样本之间的均值是否存在显着差异。该方法通过计算不同样本的方差,并比较其差异程度,从而判断样本之间的差异是否显着。方差分析法常用于实验数据的分析和处理。

三、回归分析法

回归分析法是一种用于研究变量之间关系的统计方法。通过收集大量数据,建立变量之间的回归方程,进而分析变量之间的相关性和预测关系。常用的回归分析方法包括线性回归、逻辑回归等。回归分析法在社会科学、医学、经济学等领域有广泛应用。

四、聚类分析法

聚类分析法是一种无监督学习方法,用于将相似的对象分组。该方法根据数据的特征,将其划分为不同的群组,使得同一群组内的数据相似度较高,不同群组间的数据相似度较低。聚类分析法常用于数据挖掘、市场细分等领域。

以上就是对统计学中几种常见检验方法的简单介绍。每种方法都有其特定的应用条件和适用范围,需要根据实际情况选择适当的检验方法。同时,这些方法也需要结合具体的数据特点和问题背景进行灵活运用,以达到有效的统计推断和决策支持。

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