後葡萄膜炎包括多種，有脈絡膜炎、視網膜炎、玻璃體炎、視網膜血管炎。治療首先要分清是感染性後葡萄膜炎，還是非感染性後葡萄膜炎。如果患者是感染性後葡萄膜炎，會尋找感染原因，可能是真菌後葡萄膜炎、細菌後葡萄膜炎，也可能是寄生蟲後葡萄膜炎、病毒後葡萄膜炎。所以，可針對微生物和感染類型，進行抗細菌、抗真菌、驅蛔蟲、抗病毒治療。
對於結核性葡萄膜炎，可進行抗結核治療。對於非感染性葡萄膜炎，一般是自身免疫性，口服激素葯物強的松以及口服環孢素、環磷醯胺等免疫抑制劑葯物治療。但上述葯物副作用多，且治療時間特別長，可能超過半年到一年，部分後葡萄膜炎患者需要終身服葯。