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分子生物學的鑒定方法有哪些

發布時間:2022-08-15 06:30:51

哪些分子生物學方法可用於鑒定染色體異常

DNA-DNA雜交,該技術被認為是細菌分類和鑒定的「黃金法則」,主要方法如下:標記法、吸光度法、熒光強度法等。
16SrRNA法:細菌核糖體的RNA有三種類型,(23S、16S、5S)rRNA,其中16S被認為作為生物系統發育和分類指標最為合適。
細菌核心基因(看家基因),包括gyrB、rpoB、groEL、recN等。

如何鑒定菌種

在杏鮑菇、白靈菇生產中,只有具備優良的菌種,通過科學的培育管理,才能實現優質、高產、高效。因此菌種的優劣是事關千家萬戶的切身利益和菌種生產廠家信譽的大事。在現實生產中,也常發現有的菌種廠以贏利為目的,粗製濫造。加之有些菇農對菌種質量缺乏識別能力,致使在生產中減產、絕收,造成巨大的經濟損失。因此嚴格菌種質量,加強對菌種的鑒定和識別是當前食用菌發展中的首要任務,也是最主要的技術環節和要求。
菌種質量的鑒定,嚴格地講,應從形態、生理、栽培和經濟效益等方面進行綜合檢測和評價。但要完成各種指標,除了需掌握一定的基礎知識和基本技術外,還需具備一定的儀器設備及人力物力和時間。因此,一般生產者是很難完成的。這里僅將幾種常用、簡便、易行的方法予以介紹,供生產者參考。
(1)直接觀察。
對引進的母種,首先要用肉眼觀察包裝是否符合要求,棉塞有無松動,試管有無破損,棉塞中有無雜菌和病蟲害侵染,菌絲色澤是否正常、有無老化等現象。購進或自製的原種,瓶內菌絲應粗壯整齊、分枝濃密、色濃白呈絨毛狀,說明生長旺盛。如瓶底出現黃水、菌絲萎縮與瓶壁脫離,或出現原基扭結,說明菌種老化應淘汰。(2)菌種純度檢查。
杏鮑菇菌絲是純白色的,白靈菇菌絲較杏鮑菇菌絲稍淺些。如在菌種管或菌種瓶中出現其他顏色的菌絲或孢子(綠色、黃色、黑色等),則說明菌種不純,被雜菌污染不能使用。如果在接菌時發現菌種有異味也說明菌種被雜菌污染,不能使用。(3)吃料能力鑒定。
將母種接入最佳配方的原種培養基中,或將原種接入栽培袋中觀察菌絲生長情況。經1周的培養,如果菌種塊能很快萌發並迅速向四周的培養料中生長伸展,說明菌種的吃料能力強。反之,菌種塊萌發後生長緩慢,遲遲不向四周和料層深處伸展,則表明菌種對培養料的適應能力差。(4)觀察菌絲長勢。
可先將供測的菌種接入其適宜的試管培養基上進行培養,如果菌絲生長整齊濃密、健壯有力,則表明為優良菌種。若菌絲生長緩慢或長速太快,稀疏無力,參差不齊,容易衰老,則表明菌種質劣。(5)栽培試驗觀察。
這是菌種質量鑒定最可靠的方法。通過一定的栽培試驗,凡具備優質高產、抗雜能力強和遺傳性穩定的菌株,才是優良和可推廣應用的品種。

㈢ 細菌的分子生物學鑒定要怎麼

是的,要做PCR。
首先你要提出細菌的DNA。
方法如下:
1、液體培養及保種:從斜面上挑取菌苔於液體培養基中放搖床上震盪(轉速160r/min)培養16小時。吸取菌液於1.5ml的經過滅菌的EP管中,再加甘油(30-40%)進行保種。(-80攝氏度保藏2年)
2、提取DNA(CTAB法):
(1)取1.5ml菌液於1.
5ml離心管中,12000r/min離心2min,棄上清。
(2)向沉澱物中加入350ul雙蒸水,重新懸浮沉澱。
(3)加入20ul10%SDS和3ul的蛋白酶K(20mg/ml),溶菌酶3ul,混勻,於50℃溫育1h。
(4)加入50ul
5mol/L
NaCl溶液,充分混勻,再加入50ul
CTAB/NaCl溶液,混合後再65℃溫育30min。
(6)冷卻後加入等體積的酚(沉澱蛋白質):氯仿:異戊醇(增強酚的作用)(25:24:1),小心上下顛倒混勻,12000r/min離心5min,將上清液轉移到新的EP管,重復此步驟2-3次,直至分層界面無白色沉澱。
(7)加入等體積的氯仿:異戊醇(24:1),小心顛倒混勻,12000r/min離心5min將上清液轉移到新的EP管。(純化作用)
(8)加入0.6倍體積的異丙醇,輕輕混合直到DNA沉澱下來,12000r/min離心15min棄上清。
(9)向離心管中加入75%乙醇,12000r/min離心5min洗滌DNA沉澱,小心棄上清,重復洗滌1次,棄上清將離心管倒置於吸水紙上,晾乾。
(10)加入50ul(雙蒸水)/
TE
Buffer溶解DNA於4℃保存。
(11)電泳檢測
6、PCR擴增:(細菌的通用引物為27F和1492R)將提取得到的DNA進行PCR擴增,電泳檢測擴增得到的16S
rDNA(如果菌類分明,條帶清晰,PCR原液可直接送去測序,雙向測通,得到測序序列後到NCBI的BLAST頁面比對,得出鑒定結果)
7、酶切帶型分型確定操作單元:將擴增產物用HhaI和HaeIII兩種限制性內切酶進行酶切,電泳檢測酶切產物,酶切帶型相同的分為一個操作單元。
8、連接轉化:從每一個操作單元中選取一株菌的16S
rDNA進行連接實驗。將連接產物轉入感受態細胞中,將感受態細胞塗布於含有Amp的平板上,倒置培養12-16h。
9、克隆子挑選及PCR鑒定:從上一步的平板上挑取單菌落於含有Amp的液體培養基中震盪培養12h,以培養液為模板直接進行PCR擴增鑒定(1000-2000bp)。將含有目的片段的克隆子菌液低溫保存。
10、測序:將含有目的片段的克隆子菌液送去測序。
11、序列拼接:運用DNAMAN軟體對測序得到的序列進行拼接。
12、建樹:對拼接得到的序列用Blast進行比對,最後將比對得到的所有序列運用MEGA6建立系統發育樹。

㈣ 細胞內DNA、RNA、蛋白質常用的分子生物學檢測方法shi

細胞內DNA用甲基綠檢測,而rna用吡羅紅檢測,蛋白質則用雙縮脲試劑檢測。

㈤ 介紹一下這幾種生物學鑒定方法

DNA印跡技術由Southern於1975年創建,稱為Southern印跡技術,RNA印跡技術正好與DNA相對應,故被稱為Northern印跡雜交,與此原理相似的蛋白質印跡技術則被稱為Western blot。 Southern印跡雜交是進行基因組DNA特定序列定位的通用方法。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性並在原位將單鏈DNA片段轉移至尼龍膜或其他固相支持物上,經干烤或者紫外線照射固定,再與相對應結構的標記探針進行雜交,用放射自顯影或酶反應顯色,從而檢測特定DNA分子的含量。 Northern印跡雜交(Northern blot),是一種將RNA從瓊脂糖凝膠中轉印到硝酸纖維素膜上的方法。Northern 印跡雜交的RNA吸印與Southern印跡雜交的DNA吸印方法類似,只是在進樣前用甲基氫氧化銀、乙二醛或甲醛使RNA變性,而不用NaOH,因為它會水解RNA的2'-羥基基團。RNA變性後有利於在轉印過程中與硝酸纖維素膜結合,它同樣可在高鹽中進行轉印,但在烘烤前與膜結合得並不牢固,所以在轉印後用低鹽緩沖液洗脫,否則RNA會被洗脫。 Western Blot中文一般稱為蛋白質印跡。它是分子生物學、生物化學和免疫遺傳學中常用的一種實驗方法。其基本原理是通過特異性抗體對凝膠電泳處理過的細胞或生物組織樣品進行著色。通過分析著色的位置和著色深度獲得特定蛋白質在所分析的細胞或組織中的表達情況的信息。 離子交換層析(Ion Exchange Chromatography簡稱為IEC)是以離子交換劑為固定相,依據流動相中的組分離子與交換劑上的平衡離子進行可逆交換時的結合力大小的差別而進行分離的一種層析方法。 (不知道這個是不是你所提到的親和鑒定?)將具有特殊結構的親和分子製成固相吸附劑放置在層析柱中,當要被分離的蛋白混合液通過層析柱時,與吸附劑具有親和能力的蛋白質就會被吸附而滯留在層析柱中。那些沒有親和力的蛋白質由於不被吸附,直接流出,從而與被分離的蛋白質分開,然後選用適當的洗脫液, 改變結合條件將被結合的蛋白質洗脫下來,這種分離純化蛋白質的方法稱為親和層析。 雙脫氧末端終止測序法:核酸模板在核酸聚合酶、引物、四種單脫氧鹼基存在條件下復制或轉錄時,如果在四管反應系統中分別按比例引入四種雙脫氧鹼基,只要雙脫氧鹼基摻入鏈端,該鏈就停止延長,鏈端摻入單脫氧鹼基的片段可繼續延長。如此每管反應體系中便合成以共同引物為5』端,以雙脫氧鹼基為3』端的一系列長度不等的核酸片段。反應終止後,分四個泳道進行電泳。以分離長短不一的核酸片段(長度相鄰者僅差一個鹼基),根據片段3』端的雙脫氧鹼基,便可依次閱讀合成片段的鹼基排列順序。
記得採納啊

㈥ 菌種鑒定的方法

傳統方法細菌做革蘭氏染色 運動性試驗 各種代謝 然後查伯傑氏細菌手冊;用分子做的話提總DNA,pcr擴增16srDNA全長片段,上NCBI資料庫比對,選擇近緣序列構建系統發育樹鑒定。
真菌的話主要根據形態,特別是有性型生殖形態鑒定;分子的話一般擴增ITS區域,比對,建樹鑒定。

㈦ 與分子生物學相關的實驗方法有哪些

與分子生物學相關的實驗方法有哪些

主要包括植物、動物、微生物基因組DNA的提取與鑒定,哺乳動物組織總RNA的提取與鑒定,質粒DNA的提取與鑒定,PCR擴增,分子雜交技術,限制性內切酶消化,分子克隆全過程和基因文庫的構建等實驗項目的原理及步驟。

分子生物學(molecular biology ):從分子水平上研究生命現象物質基礎的學科。研究細胞成分的物理、化學的性質和變化以及這些性質和變化與生命現象的關系,如遺傳信息的傳遞,基因的結構、復制、轉錄、翻譯、表達調控和表達產物的生理功能,以及細胞信號的轉導等。

分子生物學中最基本的技術是蛋白質的表達和純化。首先是編碼目的蛋白的DNA序列被克隆(用PCR技術和限制性內切酶)到作為表達載體的質粒中。隨後構建好的質粒被引入到宿主細胞。編碼序列在質粒上的特殊的啟動子元件的驅動下,被宿主細胞的表達系統所表達。質粒上通常還帶有抗生素抗性標簽以便於質粒篩選。

質粒可以被插入到細菌或動物細胞。外源DNA被引入細菌被稱為轉化,可以通過電穿孔法、微注射法、正吸收和融合來實現;外源DNA被引入真核細胞,如動物細胞,被稱為轉染,轉染技術包括磷酸鈣法、脂質體法和一些有專利權的商用轉染試劑。DNA也可以以病毒或病原菌為載體被帶入宿主細胞;應用這種病毒或病菌的轉染技術於細胞時,用術語來說就是「對細胞進行轉導(transce)」。

多聚酶鏈式反應(PCR)是一項用於體外復制DNA的極為通用的技術。簡而言之,PCR技術可以使單鏈DNA被復制數百萬次,也允許用事先確定好的方式對被復制的DNA序列進行改動。例如,PCR技術可以用於引入限制性酶切位點,或者對特定的DNA鹼基進行突變(改變)。PCR技術還可以用於從cDNA文庫獲得特定的DNA片斷,或者從另一個角度,用於判斷一個cDNA文庫中是否含有特定的DNA片斷。

凝膠電泳是分子生物學最主要的一項技術。其基本原理是:DNA、RNA和蛋白質可以用電場來進行分離。在瓊脂糖凝膠電泳中,DNA和RNA可以被瓊脂糖凝膠按其分子大小進行分離。同樣,蛋白質可以被SDS-聚丙烯醯胺凝膠電泳(SDS-PAGE)按分子量大小分離;此外,蛋白質還可以由於所帶電荷的不同被等電聚焦電泳分離。

㈧ 分子生物學的研究方法有哪些

分子生物學(molecular biology ):從分子水平上研究生命現象物質基礎的學科。研究細胞成分的物理、化學的性質和變化以及這些性質和變化與生命現象的關系,如遺傳信息的傳遞,基因的結構、復制、轉錄、翻譯、表達調控和表達產物的生理功能,以及細胞信號的轉導等。

分子生物學中最基本的技術是蛋白質的表達和純化。首先是編碼目的蛋白的DNA序列被克隆(用PCR技術和限制性內切酶)到作為表達載體的質粒中。隨後構建好的質粒被引入到宿主細胞。編碼序列在質粒上的特殊的啟動子元件的驅動下,被宿主細胞的表達系統所表達。質粒上通常還帶有抗生素抗性標簽以便於質粒篩選。

質粒可以被插入到細菌或動物細胞。外源DNA被引入細菌被稱為轉化,可以通過電穿孔法、微注射法、正吸收和融合來實現;外源DNA被引入真核細胞,如動物細胞,被稱為轉染,轉染技術包括磷酸鈣法、脂質體法和一些有專利權的商用轉染試劑。DNA也可以以病毒或病原菌為載體被帶入宿主細胞;應用這種病毒或病菌的轉染技術於細胞時,用術語來說就是「對細胞進行轉導(transce)」。

多聚酶鏈式反應(PCR)是一項用於體外復制DNA的極為通用的技術。簡而言之,PCR技術可以使單鏈DNA被復制數百萬次,也允許用事先確定好的方式對被復制的DNA序列進行改動。例如,PCR技術可以用於引入限制性酶切位點,或者對特定的DNA鹼基進行突變(改變)。PCR技術還可以用於從cDNA文庫獲得特定的DNA片斷,或者從另一個角度,用於判斷一個cDNA文庫中是否含有特定的DNA片斷。

凝膠電泳是分子生物學最主要的一項技術。其基本原理是:DNA、RNA和蛋白質可以用電場來進行分離。在瓊脂糖凝膠電泳中,DNA和RNA可以被瓊脂糖凝膠按其分子大小進行分離。同樣,蛋白質可以被SDS-聚丙烯醯胺凝膠電泳(SDS-PAGE)按分子量大小分離;此外,蛋白質還可以由於所帶電荷的不同被等電聚焦電泳分離。

㈨ 如何利用分子生物學進行品種鑒定

如何利用分子生物學進行品種鑒定
利用基因測序技術就可以.品種之間的基因保守性序列差異很小,但是特異性序列之間差異很大,可以利用保守性序列設計引物進行PCR擴增,將得到的帶進行核酸序列測定即可區分.

㈩ 哪些分子生物學技術被用於對細菌的分類,鑒定

1、細菌常規鑒定方法
1. 1 免疫診斷技術
1. 1. 1凝集試驗
目前常用的是葡萄球菌協同凝集試驗(SPA - CoA) ,金黃色葡萄球菌細胞壁的A 蛋白(SPA) 能與動物血清中IgG的Fc 結合,成為致敏的顆粒載體,特異性IgG的Fc 與SPA 結合後, F (ab』) 2 段暴露在葡萄球菌表面,與相應細菌反應呈現凝集現象,此法用於細菌快速鑒定和分型。
1. 1. 2免疫酶技術
免疫酶技術( EIA , Enzymeimmunoa2ssay) 是將酶標記的抗抗體與抗原—抗體復合物結合形成抗原- 抗體- 酶標記抗抗體復合物,加入酶底物產生有色產物。以酶聯免疫吸附測定( ELISA) 和斑點酶聯免疫吸附技術(Dot - ELISA) 應用較廣泛。
1.1. 3 免疫熒光技術
免疫熒光技術( FIA , Fuorescenceimmunoassay) 是將一抗滴加於待檢抗原上,再加一抗的熒光抗體(二抗) ,呈現特異性的熒光抗原抗體復合物以鑒定病原菌。此法比ELISA 更直觀,可直接觀察到菌體形態。
1. 1. 4放射免疫測定技術
放射免疫測定( RIA , Rad2ioimmunoassay) 是用放射性同位素標記抗原或抗體,與相應的抗體或抗原結合後通過放射自顯影定性和定量抗原或抗體。
1. 1. 5免疫膠體金標記技術
膠體金是繼酶、熒光素和放射同位素後免疫標記技術中令人矚目的新標記物。膠體金是氯金酸(HAuCl4)在還原劑如白磷、枸櫞酸鈉等的作用下,聚合成特定大小的金顆粒,通過靜電作用與抗體或抗原形成一種穩定的膠體狀態,即為免疫金,免疫金與相應的抗原抗體結合後,呈現特定的顏色反應。
1. 2 蛋白質圖譜分析
蛋白質圖譜分析主要採用聚丙烯醯胺凝膠電泳( PAGE,Polyacrylamide Gel Electrophoresis)和SDS -PAGE。聚丙烯醯胺凝膠是單體丙烯醯胺(Acr) 和
N ,N』- 亞甲雙丙烯醯胺(Bis) 在催化劑過硫酸銨和加速劑四甲基乙二胺(TEMED)作用下聚合為含醯胺基側鏈的脂肪族長鏈,相鄰長鏈通過甲叉橋連接形成三維網狀結構物質,PAGE 根據電荷、形狀和分子大小分離和定性、定量分析蛋白質和多肽。SDS - PAGE 根據分子量的不同分離蛋白質,SDS 是一種陰離子表面活性劑,與蛋白質疏水部分結合使蛋白質帶大量負電荷且使蛋白質的形狀趨向一致,抵消了蛋白質本身所帶電荷和形狀的影響,因此,樣品分子量的對數與其在凝膠中的遷移率呈直線關系。

詳見 http://epub.cnki.net/kns/brief/default_result.aspx

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