1. 绝对荧光定量PCR的数据分析
现在最常用的两种分析实时定量PCR 实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝数;相对定量方法则是比较经过处理的样品和未经处理的样品目标转录本之间的表达差异。2-△△CT方法是实时定量PCR 实验中分析基因表达相对变化的一种简便方法,即相对定量的一种简便方法。本文介绍了该方法的推导,假设及其应用。另外,在本文中我们还介绍了两种2-△△CT衍生方法的推导和应用,它们在实时定量 PCR 数据分析中可能会被用到。 希望对您有所帮助
2. 求助实时荧光定量PCR数据分析高手
现在最常用的两种分析实时定量pcr
实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝数;相对定量方法则是比较经过处理的样品和未经处理的样品目标转录本之间的表达差异。2-△△ct方法是实时定量pcr
实验中分析基因表达相对变化的一种简便方法,即相对定量的一种简便方法。本文介绍了该方法的推导,假设及其应用。另外,在本文中我们还介绍了两种2-△△ct衍生方法的推导和应用,它们在实时定量
pcr
数据分析中可能会被用到。
希望对您有所帮助
3. 荧光物含量测定方法的定量测定
荧光分析法的定量测定方法较多,可分为直接测定法和间接测定法两类。
a.直接测定法:
利用荧光分析法对被分析物质进行浓度测定,最简单的便是直接测定法。某些物质只要本身能发荧光,只须将含这类物质的样品作适当的前处理或分离除去干扰物质,即可通过测量它的荧光强度来测定其浓度。具体方法有两种。
1. 直接比较法:配制标准溶液的荧光强度Fx,已知标准溶液的浓度Cs,便可求得样品中待测荧光物质的含量。
如果空白溶液的荧光强度调不到零,则必须从Fs和Fx值中扣除空白溶液的荧光强度F0,然后进行计算。
2. 标准曲线法:将已知含量的标准品经过和样品同样处理后,配成一系列标准溶液,测定其荧光强度,以荧光强度对荧光物质含量绘制标准曲线。再测定样品溶液的荧光强度,由标准曲线便可求出样品中待测荧光物质的含量。
为了使各次所绘制的标准曲线能重合一致,每次应以同一标准溶液对仪器进行校正。如果该溶液在紫外光照射下不够稳定,则必须改用另一种稳定而荧光峰相近的标准溶液来进行校正。例如,测定维生素B1时,可用硫酸奎宁溶液作为基准校正仪器。
b、间接测定法:
有许多物质,它们本身不能发荧光,或者荧光量子产率很低,仅能显现非常微弱的荧光,无法直接测定,这时可采用间接测定方法。
间接测定方法有以下几种:
1.化学转化法:通过化学反应将非荧光物质变为适合于测定的荧光物质。例如金属与螯合剂反应生成具有荧光的螯合物。有机化合物可通过光化学反应、氧化还原、偶联、缩合反等应,使它们转化为荧光物质。
2.荧光猝灭法:这种方法是利用本身不发荧光的被分析物质能使某种荧光化合物的荧光猝灭的性质,通过测量荧光化合物荧光强度的下降,间接地测定该物质的浓度。
3.敏化发光法:对于很低浓度的分析物质,如果采用一般的荧s光测定方法,其荧光信号太弱而无法检测,可使用一种物质(敏化剂)以吸收激发光,然后将激发光能传递给发荧光的分析物质,从而提高被分析物质测定的灵敏度。
4. 荧光定量pcr数据分析的方法有几种
公式如上所列,仅供参考
5. 荧光定量的方法有哪些
可以做siRNA或者miRNA降低其蛋白表达量,观察表型;提高蛋白表达,观察表型;PT-PCR可用作研究其对预测下游目的基因的mRNA表达量的影响。荧光定量PCR对此意义不大,荧光定量用来检测蛋白定量还行。
6. 荧光强度分析有哪些方法
这样我们就得出了图片的平均荧光强度,但需要注意的是:免疫荧光是半定量分析,平均荧光强度只能半定量地表征特异性蛋白的表达。 主要是因为免疫荧光实验中的人为因素太...
7. 实时荧光定量PCR的结果该怎样分析
1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;
2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;
3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;
4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;
5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价值了,平时我们实验室用BIODAI-PCR荧光定量法测得的扩增曲线的起跳值基本在30左右。
(7)常用荧光定量分析方法有扩展阅读:
PVR的循环参数:
1、预变性;
模板DNA完全变性与PCR酶的完全激活对PCR能否成功至关重要,加热时间参考试剂说明书。
2、变性步骤;
循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。
3、引物退火;
退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。退火温度对PCR的特异性有较大影响。
4、引物延伸;
引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。
5、循环数;
大多数PCR含25-35循环,过多易产生非特异扩增。
6、最后延伸;
在最后一个循环后,反应在72℃维持10-30分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。
8. 荧光检测方法
荧光检测是一种自然发光反应,通过荧光素酶与 ATP进行反应,可检测人体细胞、细菌、霉菌、食物残渣,在15秒钟内得到反应结果。光照度通过专用设备进行测量,并以数字形式予以表示,在1975年首先被应用到食品工业中,在1985年在化妆品制造业中得到应用。
荧光定量:采用国际主流的荧光定量PCR技术,迅速提升技术水平。
结果稳定:检测结果CV值与进口全自动PCR仪接近,具有自检功能,避免错误数据的输出。
封闭操作:全部检测过程均为闭管操作,于反应管处检测荧光,有效防止污染,解决PCR技术中最棘手之难题。
准确定量:满足临床对量化的需求,定量荡围宽,可涵盖大部分病原微生物,自动曲线拟合。
灵敏度高:利用光谱信号灵敏性的优势,有效提高检测灵敏度。
安全:全程无毒检测。
操作简便:省去后处理的烦琐过程。
直接打印:直接打印结果,无须记录大量数据。
升级版:FS1000有与电脑连接的数传输口,可以连接电脑,根据用户需要提供先进分析软件,全面分析实验数据。(电脑和打印机选配件)
故障率低:维护非常简单。
节约资源:可利用现用PCR扩增仪,最大限度节约资源。
9. 请问:做荧光定量PCR时,△△Ct值是什么意思,它的计算公式是什么
△△Ct是荧光定量计算公式的简化形式,用于比较不同样品之间的差别或变化比率。
Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX₀+lgN/lg(1+Ex),其中,n为扩增反应的循环次数,X₀为初始模板量,Ex为扩增效率,N为荧光扩增信号达到阈值强度时扩增产物的量。△Ct(n)=Ct(目的基因)-Ct(内参基因);△△CT(n)=△Ct(n)-△Ct(1)。
起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。
(9)常用荧光定量分析方法有扩展阅读
荧光定量PCR的原理:
荧光定量PCR技术:在PCR反应体系中加入荧光基团,通过荧光信号不断累积而实现实时监测PCR全程,然后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在实时荧光定量PCR中,对全程PCR扩增过程进行实时检测,根据反应时间和荧光信号的变化可以绘制成一条曲线。
实时荧光定量常用的荧光化学分类有SYBR Green I法和Tag Man探针法。
Ct值:C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含义是每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。