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核酸修饰的分析方法

发布时间:2022-05-17 12:43:18

‘壹’ 核酸种类的检测方法

现在一般使用高效液相色谱法来分析,常规的有紫外分光光度法,但是不如高效液相色谱法精确。

‘贰’ 核酸检验方法

核酸检测具体流程如下:
1. 核酸提取
使用硅胶柱离心、磁性硅胶颗粒分离方法以及自动化仪器等商品化试剂或设备并按说明书操作。提取RNA时应注意防止RNA降解。DNA应置于-20℃保存,RNA和需长期保存的DNA应置于-80℃保存。
2. 逆转录合成cDNA
逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。建议使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。
3. PCR扩增反应(使用二次扩增的套式PCR扩增方法)
PCR反应需使用引物、dNTPs、DNA聚合酶(如Taq酶等)、缓冲液、和适量无RNA/DNA酶超纯水、以及模板(DNA或cDNA)。在扩增仪中,按照设定的程序进行扩增。使用二次扩增的套式PCR扩增方法。
4. 扩增产物定性分析
扩增产物常用分析方法是琼脂糖凝胶电泳法,与分子量标准比较,判断扩增片段是否在预期的分子量范围内。其它扩增产物分析方法还有限制性内切酶酶切分析、特异性探针杂交分析以及DNA序列分析等。自动化核酸扩增仪使用酶联比色分析或荧光探针杂交等原理测定。
5.结果判定和完成报告单
(1)实验成立的条件:每一次检测需同时做两个阳性对照、两个阴性对照,只有阳性对照扩增出预期的片段、阴性对照没有扩增出任何片段、双份平行样品结果一致的情况下实验才成立,可以作出核酸阳性或阴性反应结果的判定。
(2)HIV核酸检测阳性:发现核酸阳性反应,应该重复采集样品进行复测,复测结果呈核酸阳性反应则判定为核酸阳性,复测结果为核酸阴性反应则判为不确定结果,需进一步随访检测。
(3)HIV核酸检测阴性:只可报告本次实验结果阴性。
(4)应在完成检测后5个工作日内发出检测报告。

‘叁’ 核酸检测方法有哪些

核酸检测主要是鼻拭子或咽拭子法,经由鼻孔或口腔插入取得上呼吸道分泌物标本后送实验室检测。核酸检测主要是指目前对于新型冠状病毒肺炎的一种确诊的实验手段,核酸检测一般分为鼻拭子、咽拭子或者肺泡灌洗液以及痰液,通过呼吸道的标本,我们在实验室里可以检测2019新型冠状病毒的核酸,从而作为临床诊断的重要的依据。那临床上目前最常采用的检测方法是鼻拭子或者是咽拭子,操作的时候由医护人员采用特制的长柄取样的棉签,经由鼻孔或者经由口腔插入到鼻腔及咽腔中,在咽喉壁或者鼻腔的粘膜上进行涂抹,取得上呼吸道分泌物标本,这个标本取出之后再送到实验室进行相关的核酸检测。在做的过程中患者不用紧张,可能会有轻微的不适例如恶心,相信配合好医护人员的话,能够很快完成这个检查,不会给您带来很大的影响。

‘肆’ 核酸含量的测定方法及原理都有哪些

核酸检测的主要原理其实是反转录和聚合酶链式扩增反应。也叫做RT-PCR。目前对新型冠状病毒进行的核酸检测也主要采用此种方式。简单来说就是采取患者鼻咽拭子、痰和其他下呼吸道分泌物、血液、粪便,检测人员通过。核酸提取试剂盒提取患者标本里边儿的核酸,然后把提取到的核酸放进检测试剂中进行复制扩增。然后再根据检测结果进行判断如果是阴性代表没有感染,如果是阳性代表有感染。目前对新型冠状病毒核酸检测会存在假阴性的可能,所以可以选择多次测量。如果连续两次核酸检测为阴性,同时没有临床症状可以排除感染,并且对已经感染了新型冠状病毒肺炎的患者,如果连续两次检测核酸为阴性,注意间隔时间必须大于一天,同时临床症状缓解,影像学好转也可以解除隔离。

‘伍’ 核酸检测方法

核酸检测采用咽拭子检测,有口咽拭子采样和鼻咽拭子采样两种方式。

口咽拭子采样就是在咽喉部位用棉签涂擦,刷取咽喉部位上皮细胞的检测。受检测者只要放松心情,张口发出“啊——”的声音就可以了,检测过程并没有创伤风险,是非常安全的检测。

检测时可能会有恶心、想要呕吐的不适感觉,不过这些不适症状通常只需要半分钟到两分钟左右就可以完全缓解了。鼻咽拭子采样是将一根细棉签深入鼻孔,从下鼻道深入抵达鼻咽后壁,然后捻转棉签取样。棉签进入鼻腔的深度约为鼻尖到耳垂的距离。

(5)核酸修饰的分析方法扩展阅读:

核酸检测相关知识:

核酸检测是检测病毒的方法,它可以更早发现感染。现在临床中对乙肝、丙肝、艾滋病都开展了核酸检测,可以在抗体产生前检测到血液中是否存在病毒。而一些呼吸道疾病可以通过咽拭子或者呼吸道分泌物的核酸检测来判断是否感染,以及推测是否具有传染性。

季节性流感、禽流感、冠状病毒感染等通过咽拭子检测可以方便地判断出上呼吸道是否存在病毒成份,从而判断被检测者是否属于感染者。

新冠病毒的核酸检测已经是比较成熟的检测方法了,只要在咽喉部位擦拭几秒钟就可以采集到标本。通过分析判断是否有新冠病毒的核酸成分,可以尽早发现感染者,甚至在感染者出现症状前就可以检测到阳性。

感染者经过隔离治疗后咽拭子检测阴性说明病毒已经清除,不具有传染性了。目前两次咽拭子核酸检测阴性是确诊病例和无症状感染者解除隔离的标准之一。

‘陆’ 核酸检测方法有哪些

核酸检测采用咽拭子检测,有口咽拭子采样和鼻咽拭子采样两种方式。

口咽拭子采样就是在咽喉部位用棉签涂擦,刷取咽喉部位上皮细胞的检测。受检测者只要放松心情,张口发出“啊——”的声音就可以了,检测过程并没有创伤风险,是非常安全的检测。

检测时可能会有恶心、想要呕吐的不适感觉,不过这些不适症状通常只需要半分钟到两分钟左右就可以完全缓解了。鼻咽拭子采样是将一根细棉签深入鼻孔,从下鼻道深入抵达鼻咽后壁,然后捻转棉签取样。棉签进入鼻腔的深度约为鼻尖到耳垂的距离。

(6)核酸修饰的分析方法扩展阅读:

核酸检测相关知识:

核酸检测是检测病毒的方法,它可以更早发现感染。现在临床中对乙肝、丙肝、艾滋病都开展了核酸检测,可以在抗体产生前检测到血液中是否存在病毒。而一些呼吸道疾病可以通过咽拭子或者呼吸道分泌物的核酸检测来判断是否感染,以及推测是否具有传染性。

季节性流感、禽流感、冠状病毒感染等通过咽拭子检测可以方便地判断出上呼吸道是否存在病毒成份,从而判断被检测者是否属于感染者。

新冠病毒的核酸检测已经是比较成熟的检测方法了,只要在咽喉部位擦拭几秒钟就可以采集到标本。通过分析判断是否有新冠病毒的核酸成分,可以尽早发现感染者,甚至在感染者出现症状前就可以检测到阳性。

感染者经过隔离治疗后咽拭子检测阴性说明病毒已经清除,不具有传染性了。目前两次咽拭子核酸检测阴性是确诊病例和无症状感染者解除隔离的标准之一。

‘柒’ 核酸由什么组成

这是我给楼主查到的有关信息 希望能够帮到您 o(∩_∩)o 核酸的化学组成�

核酸是生物体内的高分子化合物,包括dna和rna两大类。�

一、元素组成�

组成核酸的元素有c、h、o、n、p等,与蛋白质比较,其组成上有两个特点:一是核酸一般不含元素s,二是核酸中p元素的含量较多并且恒定,约占9~10%。因此,核酸定量测定的经典方法,是以测定p含量来代表核酸量。�

二、化学组成与基本单位�

核酸经水解可得到很多核苷酸,因此核苷酸是核酸的基本单位。核酸就是由很多单核苷酸聚合形成的多聚核苷酸。核苷酸可被水解产生核苷和磷酸,核苷还可再进一步水解,产生戊糖和含氮碱基(图15-1)。�

图15-1核酸的组成��

核苷酸中的碱基均为含氮杂环化合物,它们分别属于嘌呤衍生物和嘧啶衍生物。核苷酸中的嘌呤碱(purine)主要是鸟嘌呤(guanine,g)和腺嘌呤(adenine,a),嘧啶碱(pyrimidine)主要是胞嘧啶(cytosine,c)、尿嘧啶(uracil,u)和胸腺嘧啶(thymine,t)。dna和rna都含有鸟嘌呤(g)、腺嘌呤(a)和胞嘧啶(c);胸腺嘧啶(t)一般而言只存在于dna中,不存在于rna中;而尿嘧啶(u)只存在于rna中,不存在于dna中。它们的化学结构请参见图示。�



核酸中五种碱基中的酮基和氨基,均位于碱基环中氮原子的邻位,可以发生酮式一烯醇式或氨基�亚氨基之间的结构互变。这种互变异构在基因的突变和生物的进化中具有重要作用。

有些核酸中还含有修饰碱基(modified component),(或稀有碱基,unusual com ponent),这些碱基大多是在上述嘌呤或嘧啶碱的不同部位甲基化(methylation)或进行其它的化学修饰而形成的衍生物。一般这些碱基在核酸中的含量稀少,在各种类型核酸中的分布也不均一。dna中的修饰碱基主要见于噬菌体dna,如5-甲基胞嘧啶(m5c),5-羟甲基胞嘧啶hm5c;rna中以trna含修饰碱基最多,如1-甲基腺嘌呤(m1a),2,2一二甲基鸟嘌呤(m22g)和5,6-二氢尿嘧啶(dhu)等。�

嘌呤和嘧啶环中含有共轭双键,对260nm左右波长的紫外光有较强的吸收。碱基的这一特性常被用来对碱基、核苷、核苷酸和核酸进行定性和定量分析。�

核酸中的戊糖有核糖(ribose)和脱氧核糖(deoxyribose)两种,分别存在于核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸中。为了与碱基标号相区别,通常将戊糖的c原子编号都加上“′”,如c1′表示糖的第一位碳原子。�

戊糖与嘧啶或嘌呤碱以糖苷键连接就称为核苷,通常是戊糖的c1′与嘧啶碱的n1或嘌呤碱的n9相连接。�

核苷中戊糖的羟基与磷酸以磷酸酯键连接而成为核苷酸。生物体内的核苷酸大多数是核糖或脱氧核糖的c5′上羟基被磷酸酯化,形成5′核苷酸。核苷酸在5′进一步磷酸化即生成二磷酸核苷和三磷酸核苷。以核糖腺苷酸为例,除amp外,还有二磷酸腺苷(adp,adenosine 5′-diphosphate)和三磷酸腺苷(atp,adenosine 5′-triphosphate)两种形式。核苷酸的二磷酸酯和三磷酸酯多为核苷酸有关代谢的中间产物或者酶活性和代谢的调节物质,以及作为核苷酸有关代谢的中间产物或者酶活性和代谢的调节物质,以及作为生理储能和供能的重要形式。�

核苷酸还有环化的形式。它们主要是3′,5′-环化腺苷酸(camp,adenosine 3′,5′-cyclicmonophosphate)和3′,5′-环化鸟苷酸(cgmp,guanosine 3′,5′-cyclic monophosphate),化学结构如下。环化核苷酸在细胞内代谢的调节和跨细胞膜信号中起着十分重要的作用。

‘捌’ 核酸分析技术有哪些

总的来说包括了核酸的分离、提纯,核酸的扩增,检测,定性与定量分析等。下面以DNA为例说一下相关的概念。

1、DNA的分离提纯就那些试剂,那些步骤,网上一大堆视频的,自己去找吧。

2、扩增一般指的是PCR,需提供引物(引物具有特异性,比如说乙肝病毒基因的引物只能扩增乙肝病毒基因)、酶、底物等,三个流程一个循环:变性、复性、延长。

3、检测一般有紫外分光光度法,电泳分析,杂交分析。

(1)紫外分光光度法:此法的原理涉及到一些光学的知识,可以查询相关书籍以能更好的理解,可以做定量分析,分为单组份分析和多组分分析。

单组份分析有:

1)标准曲线法:用不通浓度的标准溶液,同一条件下测定吸光度A,以吸光度A为纵坐标,浓度为横坐标,绘制标准曲线,根据测得的待测样品吸光度,从标准曲线中便可知溶液浓度。

2)标准对照法:标准溶液浓度a,吸光度A,待测样品吸光度B,则根据朗-比定律有待测样品浓度为:B*a/A。

3)吸光系数法:吸光系数K,测得待测样品吸光度A,溶液的厚度d,根据朗-比定律,则待测样品的浓度为:A/(K*d)。

多组分分析没研究过了,自己查查相关资料吧。

(2)电泳分析是根据DNA的分子量和结构不同而在电场中的移动速度不同的原理,电泳的时候需要加MARKER或者已知的基因的片段进行测量。说说MARKER的概念吧,MARKER是由一些列一定梯度的基因片段组成的基因混合物,梯度一般有100bp,200bp,500bp等,MARKER电泳过后便形成很多条距离相等的条带,每两条条带之间的距离为前面提到的梯度值,MARKER用来做标准参考,具有标尺的作用

‘玖’ 核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些

核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些
蛋白质结构分析方法:X射线晶体衍射分析和核磁共振
x 射线衍射法的分辨率可达到原子的水平,使它可以测定亚基的空间结构、各亚基间的相对拓扑布局,还可清楚的描述配体存在与否对蛋白质的影响。多维核磁共振波谱技术已成为确定蛋白质和核酸等生物分子溶液三维结构的唯一有效手段。NM R技术最大的优点不在于它的分辨率,而在于它能对溶液中和非晶态的蛋白质进行测量。
蛋白质的序列结构测定:
1.到目前为止,最经典的蛋白质的氨基酸序列分析方法是,sarI等人基于Edman降解原理研制的液相蛋白质序列仪,及后来发展的固相和气相的蛋白质序列分析仪。
2.质谱:早期的质谱电离的方式主要是电子轰击电离(EI),它要求样品的挥发性好,一般与
气相色谱联用。但使用G C/M S分析,肽的长度受到限制,只能分析小的肽段。近年来,
在离子化的技术及仪器方面取得了突破性进展,使得质谱所能测定的分子量的范围大大超
出了10k u。因此,软离子化技术、基质辅助的激光解吸/离子化(MALDI)和电喷雾离子化(E SI)显得尤为有前途。通过串联质谱技术(MS/MS)和源后衰减基质辅助的激光解吸/离子化(PSD—MAIDI—MS),人们就可以从质谱分析中获得肽及蛋白质的结构信息。

‘拾’ 如何对一条全新的的核酸序列进行功能分析

有两种方法:一、可以提取产生这种蛋白的细胞总RNA,逆转录,做成cDNA文库。再把这种蛋白从两端各测一段序列,根据密码子表再翻译成DNA序列(不止一种),根据这些序列全部做成DNA探针,再结合,然后把该蛋白的基因调出来。二、提取该蛋白,用兔子/小鼠/绵羊等哺乳动物做成该蛋白的抗体,再用抗体去调出正在翻译的该蛋白的mRNA序列,因为在翻译过程中,正在翻译的蛋白由核糖体介导与该蛋白的mRNA相连,调出后就好办了

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