① 基因序列比较怎么分析
基因序列比较怎么分析
测序得到基因序列后一般都需要进行序列比对，看和目的序列的差异情况，常用的软件有DNAman,还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对，推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。
不用担心，多熟悉几遍就可以操作了，很简单的，要对自己有信心，加油！
② 急急急！请问测得了基因序列怎么进行同源性比对和构建进化树啊谁可以帮我...不胜感激！
你可以把需要比对的序列用fasta格式保存在记事本里，然后用clustalW/clustalX的多重比对选项，直接按它默认的算法算算，生成的.dnd格式拿到MAGA里面的phylogeny——display newick tree from file选项中打开。就成了进化树了。可以在里面调整成你想要的表示方法和顺序，另存为就好了。
还有就是用DNAMAN , 多重比对（画了多条线并横着排列的标志multiple alignment），点了之后，将fasta格式保存的文件打开，选择是DNA还是蛋白质，然后以默认程序运算，出现的界面中选output——tree——最后一个，就有树了。你可以以不同的方式调整，然后输出。
如果还不行，你可以去网上搜搜相关说明书，那里会有比较详细的步骤。
希望能帮到你哈！
③ 怎么比对同一基因在人，小鼠和大鼠间的同源性
在GENE数据库上查找你的c-met的序列,分别比较人和鼠的相似性,有相关网站可以做,如SWISS等,根据相似比例判断同源性.
同源性（homology）这个概念不能量化,“两条序列具有同源性”或者“不具有同源性”.而相似性（similarity）和一致性（identity）可以看做是从不同的角度对同源性的量化指标,一般地,两条序列之间的相似性（similarity）的程度会大于一致性（identity）的程度.一般来说,序列之间的相似性（similarity）和一致性（identity）越高,序列之间同源的可能性越大.下面这段描述是三者正确的描述.
例：A序列包含有一个1500bp的ORF,通过BLAST,得知该序列与B序列同源,相似性高达94.3%,一致性达89.6%.
④ 基因序列的比对方法
你可以上网在NCBI上比对，如果你要比对两个已知序列的同源性，也可以用DNAMAN等软件比对同源性等等。
NCBI网址 http://www.ncbi.nlm.nih.gov 如果还有不明白可以用网络给我短消息我们QQ上聊。
⑤ 如何在ncbi中比对两个序列的同源性
你在用DNAMAN的多序列比对时，在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧？包括编码链和非编码连的比对，你测序得到的目的片段可能是非编码链（即你目的基因的编码链的互补序列），而NCBI中提交的序列都是编码链的序列。
⑥ 如何用DNAstar进行同源性分析
这与其编码蛋白的功能有关，常易被忽视。 采用反向PCR技术对阳性病料中的6株猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)进行全基因的扩增，得到18份PCV2阳性病料，说明ORF1非常保守。 应用Mega和CLUSTAL分析对分离株和国内外已发表的34株PCV2及2株PCV1序列进行比较.0％和98，得到长度为1768或1767bp的目的基因片段.9％～100.9％～100％和92Porcine circovirus type2(PCV2)不仅是引起仔猪断奶多系统衰竭征的主要病原体。本实验分离株皆属第二群，而且还与其它病症相关。 应用DNAstar序列分析对所测定的6株PCV2序列进行同源性分析.5％～100％，说明广西株与法国株亲缘关系较近，以美国和加拿大为代表的一群，这种可导致机体免疫抑制的病毒，分离株ORF1的核苷酸及氨基酸之间的同源性分别为96，其中两个与病毒的抗原表位相对应，分为两大群.1％～100％，两个基因型遗传距离上相对较远，以及以法国为代表的一群。分离株ORF2之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为92、克隆和测序。PCV2的危害在于能够使感染猪只的免疫功能受到损害，与国外已发表毒株的ORF2比较，分为两群。应用计算机分析两个主要阅读框ORF1和ORF2并推导其氨基酸序列，推测这些变异可能与PCV2抗原性及致病性的改变有关，并建立了遗传进化树。该进化树主要分为两大群.3％～100％，由于经常以亚临床感染的形式出现。PCV2各分离株之间存在着某种地理区域上的相关性，变异相对于ORF1较大。 本研究采用PCR诊断技术对所收集的73份疑似PCV2病的病料进行检测。因此应当进一步加强对PCV2感染的流行病学及分子病学研究。结果显示，六株之间的核苷酸同源性为95，发现变异主要发生在三个区域
⑦ 基因同源性怎么分析
1．直向同源基因
直向同源基因(orthologous gene)又译为“垂直同源基因”、“正同源基因” 或“定向进化同源基因”、“直系同源基因”，是指从同一祖先垂直进化而来的基因。或者说，一个祖先物种分化产生两种新物种，那么这两种新物种共同具有的由这个祖先物种继承下来的基因就称为直向同源基因。直向同源基因通常是编码生命必需的酶、辅酶或关键性的调控蛋白的基因，具有功能保守，进化缓慢，变化速度可覆盖整个进化历史，且序列变化速度与进化距离相当等特征。大多数直向同源基因功能相同或相近，调控途径也相似， 因此在基因组序列的注释中，是最可靠的选择，例如人α一珠蛋白基因与小鼠α一珠蛋白基因。
2．横向同源基因
横向同源基因(paralogous gene)又译为“旁系同源基因”、“并系同源基因”或“平行进化同源基因”，是指由于基因重复而产生的同源基因例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因。基因重复后，进化选择压力变小、其中一条基因丢失或发生沉默都是促使横向同源基因分化产生新特性或新功能的原因。然而，虽然某些横向同源基因转录区序列相似度不高，但它们的操纵子却仍然具有较高的保守度。值得注意的是，横向同源基因并不局限于同一物种内，不同物种中由于始祖基因的复制而分化的基因也称横向同源基因，如鼠α一珠蛋白和鸡β一珠蛋白基因。
3．异源同源基因
异源同源基因(xenologous gene)是由于基因在不同物种间的横向转移(horizontal transfer)而产生的。异源同源基因在原核生物中研究比较多。最近研究表明，异源同源基因的原位取代xenolo—gous gene displacement in situ)是细菌进化的强大推动力。另外，在比较真核基因组和原核生物基因组时发现，小部分脊椎动物基因在细菌中有同源序列，而在其他真核生物中却没有发现同源序列。一种解释认为，这些基因从细菌直接水平地转移到脊椎动物的祖先，也是异源同源基因；另外一种解释则认为，是由于其他的真核生物丢失了这些基因。
⑧ 如何进行序列同源性分析及BLAST同源性步骤
将我们在序列拼接一文中得到的病毒全基因组，进行同源性分析，分析拼接得到的序列与其他序列的相似性，从而为进一步的进化树分析打好基础。
⑨ 急！在线请教高手，如何在NCBI对刚测出来的基因序列进行同源性分析
同源性分析至少要使用两条以上序列才可以。
将序列下载，使用fasta格式保存。然后用clusterX打开，对位排列即可。
⑩ 基因序列比较怎么分析
看你是要对比几条序列了，
双序列比对需要BLAST，NCBI上有，也可以在网络搜索本地版的下载下来，
多序列比对需要cluxtal X软件， 要把所有基因序列fasta格式放在一起，需要输入所有序列的fasta格式，然后进行多序列联配！