1. NF- kB Signaling Pathways 你那篇文章 谢谢
NF-kappaB是一个大家族,包括:RelA(p65)、c-Rel、RelB、NF-kappaB1
(p50/p105)、NF-kappaB2 (p52/p100)。其中以RelA(p65)研究最为深入。
通常所说的是左边的经典途径,大致意思是这样:非激活状态下,RelA(p65)与一种名为IkappaB的蛋白结合,停留在胞浆中,不发挥转录活性。当炎症因子等刺激时,IkappaB的上游激酶IkappaB
kinase(IKK)磷酸化而激活。IKK使IkappaB降解。p50有核定位信号,没有了IkappaB的束缚,p50会拽着RelA(p65)往核里面跑。RelA(p65)识别特定的DNA序列,并结合上去,从而调控靶基因的转录(这些基因的启动子上含有RelA(p65)的结合序列:5’-GGG(A/G)(C/A/T)T(C/T)-3’)。
一般来说,NF-kappaB的激活促进细胞生长,许多抗肿瘤药物以NF-kappaB为靶点,有兴趣的战友可以找些相关文献来看看。然而,某些情况下NF-kappaB的激活却有诱导凋亡的作用。
在读这篇文章以前,我一直认为NF-kappaB的激活包括这样三个过程:
(1)NF-kappaB入核。
这个过程可以用Western
blot检测核蛋白中NF-kappaB的水平,或者免疫荧光看NF-kappaB的亚细胞定位。
(2)NF-kappaB结合到DNA上。
这个过程可以用EMSA或ChIP来检测NF-kappaB与DNA的结合能力。
(3)启动某个基因的转录。
这个过程可以用荧光素酶报告基因技术检测靶基因的转录水平。NF-kappaB对靶基因的调控不仅是促进的,还可以是抑制的。而NF-kappaB既有促生长又有促凋亡的作用,不仅是由于NF-kappaB选择性地结合促生长基因或促凋亡基因启动子,还可以是对靶基因的选择性地激活或抑制。至于如何选择,关键在于刺激因素。
2. 怎么测一个基因是不是nf-kb的下游基因
有几种方法可以选择:
1.EMSA:一般都是用P标记的探针,具有放射性,要是用生物素标记的话,放射性就小了,但是花的钱就多了。最重要的是放射性的问题,必须有磷屏,否则没法做。
2.western blot: 这个抗体应该用磷酸化的P65抗体,,因为只有磷酸化的蛋白才具有活性,你要是有钱的话,可以连总蛋白和磷酸化蛋白一起做,比较完善。
3.免疫组化: 也是可以的,原理跟western blot差不多。
4.双荧光素酶:还有一种更好的方法就是promega的双荧光素酶报告系统,采用海肾和萤火虫两种荧光素酶,一种报告目的基因,一种报告内参,很好的方法,但是很贵。
总体来说,做EMSA和双荧光素酶是最好的方法,算是定量,但是EMSA有放射性,双荧光素酶比较贵。western和免疫组化只能用来半定量,但是做的人比较多,也能发高水平的杂志,相对来说比较简单,也省钱。
3. 肿瘤细胞中能检测到磷酸化的nf-kb吗
尿路出血,尿中有恶臭味等才怀疑恶性肿瘤,一般的尿液常规检查,不含癌细胞的检查。
答案补充
是否已经确诊?胰腺癌的恶性的很高!
答案补充
不用说,你已经很明白的。
4. 怎么用elisa法测定大鼠nf-kb
大鼠NF-kB Rat NF-kB ELISA Kit
ELISA试剂盒说明:
1.检测原理:采用双抗体夹心ABC-ELISA法
2.中、英文说明书可能会有不一致之处,请以英文说明书为准。
3.刚开启的酶联板孔中可能会含有少许水样物质,此为正常现象,不会对实验结果造成任何影响。
4.试剂盒保存:-20℃(较长时间不用时);2-8℃(频繁使用时)。
5.浓洗涤液低温保存会有盐析出,稀释时可在水浴中加温助溶。
5. 测nf-kb的核转录水平能不能测总的磷酸化和核的磷酸化进行比较
nf-kb是怎样实现入核调控基因转录的核因子kB(NF—kB)体系主要涉及机体防御反应、组织损伤和应激、细胞分化和调亡以及肿瘤生长抑制过程的信息传递.在多数细胞类型,NF-kB在胞浆与抑制性蛋白质结合形成无活性的复合物.当肿瘤坏死因子等作用于相应受体后,可通过第二信使Cer等激活此系统,而病毒感染、脂多糖、活性氧中间体、佛波酯、双链RNA以及前述信息传递途径中活化的RKC、PkA等则可直接激活NF-kB.激活过程是通过磷酸化抑制性蛋白使其构象改变而从NF-kB脱落,使得NF-kB得以活化.活化的NF-kB进入细胞核,与DNA接触,并启动或抑制有关基因的转录.
6. NF-kB信号通路的中文版本
哺乳动物的转录因子NF-kB家族由P50(P105的处理产物,两者都被称为NF-kB1),P52(p100的处理产物,两者都被称为NF-kB2),REL(也被称为cREL),REL-A(也被称为P65)和REL-B组成。这些蛋白质二聚化后形成有功能的NF-kB。除了REL-B只能与P50或者P52有效的结合外,存在所有的同源或异源二聚体组合的可能性,并且都具有NF-kB 的活性。每一个NF-kB家族的成员都有一个保守的REL同源区(RHD),它包含三种类型的基序:结合特异性DNA序列的基序;二聚化的基序;和一个核定位的基序,也被称为核定位信号(NLS)。P50型的NF-kB1及P52型的NF-kB2 包含仅仅一个RHD,而REL、REL-A、和REL-B除包含一个RHD外,还包含一个转录活化区。在没有刺激的细胞中,大部分的NF-kB 二聚体通过与细胞质中三个抑制因子(IkBa、IkBβ、IkBε)中的一个结合而以无活性的状态存在。这些抑制因子通过它们的锚蛋白区与NF-kB二聚体结合,掩盖至少一个NLSs。原型抑制因子IkBa,也阻止其结合的二聚体与DNA的结合,并且通过其末端的一个氨基末端输出序列促进二聚体的出核作用。
各种信号通过降解IkBs的方式来活化NF-kB,活化的NF-kB然后进入细胞核内与DNA结合。IkBs首先是在IkBs激酶(IKK)催化下使其的两个保守的丝氨酸残基磷酸化。IKK是由一个调节亚单位,IKK-γ(也被称为NEMO)和两个催化亚单位IKK-a,IKKβ组成。接着IkBs在SCF-E3泛素化酶复合体的催化作用下多泛素化而被蛋白酶降解。活化的NF-kB转位到核内与与其相关的DNA基序结合以诱导靶基因的转录。包括多种病原的组分例如脂多糖,前炎性细胞因子,如TNF、IL-1及丝裂原等在内的多种信号活化这种途径。依赖Ikk-和IKK-降解IkBs的NF-kB活化途径被称为经典的NF-kB活化途径。其他的不被人所熟知的途径也能从IkBs中活化部分的NF-kB。这些途径包括 氨酸磷酸化诱导的IkBs解离途径和 蛋白激酶-2诱导的IkBs的流动加快的方式。释放后的NF-kB可以通过例如修饰自身的亚单位的方式来影响自身的转录激活效能。活化的NF-kB快速的诱导编码IkBa的基因的转录,因此产生高水平的自身抑制剂。新合成的自由的IkBa进入细胞核内,然后使DNA上NF-kB解离并且将NF-kB排出细胞核,因而恢复到静息状态。
广泛的IkBs家族也包括P50和P52前体形式的NF-kB1和NF-kB2,分别是P105和P100。除了P50和P52序列外,这些前体还包括IkB样的锚蛋白区,它抑制与其相关的NF-kB亚单位的活性。从前体产生P50和P52的过程还没有被人完全的理解,但他需要翻译时和翻译后的蛋白酶的加工处理活动。在翻译的同时有就会组成性的产生约等量的P50和P105,虽然这时P50还没有加工完成。P52的产生主要但不完全是由于信号诱导的P100的加工完成的。不像是IkBa、IkBβ、IkBε的降解,信号诱导的磷酸化及加工P100成P52不需要经典的IKK-γ依赖的信号途径。IKK-a和NF-kB诱导激酶(NIK)是必不可少的,但IKK-β和IKK-γ是不需要的。因而这个途径又被称为非经典的,替代的或者新的NF-kB活化途径。虽然非经典的途径并不作用于未经处理的P105,但经典的途径可以有时可以像降解IkBs那样被完全的降解,因此释放被结合的NF-kB家族成员。
REL-B很少与小IkBs结合,而P100是其主要的抑制子。非传统的途径加工处理P100产生P52-REL-B二聚体。肿瘤坏死因子超家族成员包括B细胞活化因子(BAFF,也被称为BLYS)、CD40配体、淋巴细胞毒素 和NF-kB受体活化因子配体(也被称为TRANCER)能够诱导P100的加工处理。
转自生物谷
7. NF-KB是什么
NF-KB(核因子激活的B细胞的κ-轻链增强)是一种蛋白质复合物,其控制转录的DNA,细胞因子产生和细胞存活。
NF-KB几乎存在于所有动物细胞类型中,并参与细胞对刺激的反应,如应激,细胞因子,自由基,重金属,紫外线照射,氧化LDL和细菌或病毒抗原。NF-KB在调节对感染的免疫应答中起关键作用。
NF-KB的不正确调节与癌症,炎症和自身免疫疾病,感染性休克,病毒感染和免疫发育不当有关。NF-KB也与突触可塑性和记忆过程有关。
(7)磷酸化nfkb检测方法扩展阅读:
NF-κB由Ranjan Sen(NIH)在诺贝尔奖获得者David Baltimore的实验室中通过其与B细胞中免疫球蛋白轻链增强子中的11碱基对序列的相互作用而发现。
核因子-kB(NF-kB),是细胞内重要的核转录因子。它参与机体的炎症反应、免疫应答,能调节细胞凋亡、应激反应,NF-kB过度激活,与人类许多疾病如类风湿关节炎、心脏与脑部疾病的炎症变化等相关,因此通过药物来抑制NF-kB信号转导通路,可能会成为治疗的手段。
NF-kB分子的N端含Rel同源域,参与其和DNA结合、参与二聚体化,能被NF-kB抑制物(TeB)结合、抑制;NF-kB分子内还有核输出域、核定位域、转位活性域等,C端有反式转录激活域。
p50/p65NF-KB能与靶基因启动子免疫球蛋白k轻链基因转录增强序列(kB序列)特异结合。RelA/c-Rel二聚体,能与靶基因启动子其他序列结合。
参考资料来源:网络-NF-kB信号通路
8. 测NF-kB P65的表达。急!!!!!!!
我帮你看了一下,如果是磷酸化的抗体,那肯定要买2个了.如果是没磷酸化的抗体,目前我还没有查到能一起抗2个的.他们是来自同一个转录本吗?
产品名称 货号 宿主 用途 规格 种类特异性 价格 说明书
Anti-Actiated NF-κB p65 (NLS specific) Rabbit pAb KC-5N02 Rabbit W 100 μl H, M, R 988元 详细资料
Anti-NF-κB p65 (Rel A) Mouse mAb KC-5N03 Mouse W 100 μl H, M, R 988元 详细资料
Anti-NF-κB p65 (Rel A) Rabbit pAb KC-5N01 Rabbit W 100 μl H, M, R 988元 详细资料
Anti-Phosoho-NF-κB p65 (Ser276) Rabbit pAb KC-5N05 Rabbit W, IHC 100 μl H, M, (R) 1488元 详细资料
Anti-Phosoho-NF-κB p65 (Ser536) Rabbit pAb KC-5N04
9. 请教NF-KB检测方法
NF-kB比较特殊,他基本上是ready-to-use,也就是胞内总有一定量的转录和表达,总在那里,但是被IkB所抑制不发挥作用,当信号来时,IkB被IKK磷酸化失活被泛素蛋白酶体降解,NFkB释放进入核发挥转录因子的作用
可参考下面的图
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/5e/NFKB_mechanism_of_action.png
因此对NF-kB的研究,如果只检测NFkB的WB就很难有结果了,而至少需要检测:
1. 胞内和核内NF-kB的量,也就是要区别核蛋白和胞浆蛋白,这个可以用WB;
2. 检测IkB的磷酸化,这个也可用WB,不过IkB有两个不同的泛素化位点作用不同,因此也不是很特异的方法;
3. 最经典的还是要做EMSA,直接检测NF-kB与DNA的结合,这个应该是目前最权威的试验了,推荐!!
10. 如何检测转录因子nf-kb从细胞质转移进入细胞核
mRNA通核孔细胞核转移细胞质主运输
解析:RNA蛋白质等物质通核孔进细胞核种式主运输
主运输针物质需要载体蛋白并且耗能